Se trata de un enclave de enorme biodiversidad que concentra hasta 11 ecosistemas distintos, desde los humedales de alta montaña de Peñalara, hasta los valles del Lozoya, sus extensos bosques y sus características formaciones rocosas de La Pedriza.
Las condiciones ambientales de la Sierra de Guadarrama han propiciado la convivencia de más de 30 tipos diferentes de vegetación, ocupando las mayores superficies los pinares naturales de montaña, los matorrales de cumbre, los robledales, abedulares, fresnedas adhesadas y los bosques de ribera. En este enclave natural existen más de 1.500 variedades de flora, la mitad del patrimonio vegetal de la Comunidad. De estas, 113 están catalogadas como endemismos ibéricos, y se encuentran protegidas por la normativa comunitaria. La variedad de ecosistemas y hábitats de la Sierra da lugar a su vez a una gran diversidad de especies de fauna. El 65% de la fauna madrileña, el 45% de la existente en el territorio español, unas 1280 especies, y el 18% de la fauna europea.
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